Структура
Университет действует как децентрализованная «сеть сетей», обладающая подлинно междисциплинарным и глобальным видением. В систему УООН входит центр УООН в Токио и всемирная сеть научно-исследовательских и учебных центров/программ, которым оказывают содействие многочисленные связанные с ними и сотрудничающие с ними институты.
Принципы и политика УООН определяются Советом Университета, в который входят 24 назначаемых члена, каждый из которых работает шесть лет в своем личном качестве (а не как представитель своей страны). Членами Совета по должности являются Генеральный секретарь Организации Объединенных Наций, Генеральный директор ЮНЕСКО и Директор-исполнитель Учебного и научно-исследовательского института Организации Объединенных Наций (ЮНИТАР).
Ректор УООН также является членом Совета и исполняет обязанности главного научного и административного сотрудника Университета, отвечающего за руководство его программой в целом, ее организацию и управление ею.