Francisco Songane est Directeur du Partenariat pour la santé de la mère, du nouveau-né et de l'enfant lancé par l'OMS. En tant que Ministre de la santé du Mozambique (2000-2004), on lui attribue le mérite d'avoir recouru au partenariat pour prévenir l'apparition d'épidémies durant les inondations de 2000 et 2001 et d'avoir contribué d'une manière décisive à l'élaboration et à la mise en application de la stratégie du Mozambique pour le secteur de la santé. Il a mis au point un certain nombre d'interventions innovantes dans les systèmes de santé du Mozambique, dont un vaccin contre l'hépatite B et des études sur un vaccin possible contre le paludisme. Il a été membre du Conseil d'administration et du Comité exécutif du GAVI.