La Asamblea General celebrará su debate general anual durante nueve días laborables, del martes 19 de septiembre al viernes 29 de septiembre 2006, y proporcionará a los Estados Miembros la oportunidad de expresar sus opiniones acerca de importantes cuestiones internacionales. El sexagésimo primer período de sesiones será la segunda vez que el debate general se celebrará con un tema propuesto a los Estados Miembros por el nuevo Presidente, según lo dispuesto en la resolución 58/126 de la Asamblea General. El tema sugerido para el sexagésimo primer período de sesiones es “Puesta en marcha de una alianza mundial para el desarrollo”. El Secretario General presentará su memoria sobre la labor de la Organización inmediatamente antes del debate general, práctica que se inició en el quincuagésimo segundo período de sesiones.
Una vez concluido el debate general, la Asamblea empieza a examinar los temas sustantivos de su programa. Dado el gran número de cuestiones que ha de examinar (por ejemplo, el programa del sexagésimo período de sesiones constaba de 160 temas), la Asamblea asigna a las seis Comisiones Principales los temas pertinentes para su labor; las Comisiones debaten esos temas procurando, en la medida de lo posible, armonizar los diferentes planteamientos de los Estados y luego someten proyectos de resolución y decisión a la consideración de la Asamblea, reunida en sesión plenaria. La Primera Comisión se ocupa de las cuestiones de desarme y de las cuestiones de seguridad internacional conexas. La Comisión Política Especial y de Descolonización (Cuarta Comisión) se encarga de distintas cuestiones políticas de las que no trata la Primera Comisión, así como de la descolonización. La Segunda Comisión debate las cuestiones económicas y financieras. La Tercera Comisión examina las cuestiones sociales, humanitarias y culturales. La Quinta Comisión se ocupa de la administración y del presupuesto de las Naciones Unidas y la Sexta Comisión es la responsable de las cuestiones jurídicas internacionales.
Por otra parte, la Asamblea adopta medidas directamente en sus sesiones plenarias sobre algunos temas del programa, como la cuestión de Palestina y la situación en el Oriente Medio.