Начиная с 90-х годов ХХ века миротворческая деятельность ООН все больше осуществляется в партнерском взаимодействии с региональными организациями. Первой операцией ООН, развернутой в том же месте, где проводилась операция региональных сил по поддержанию мира, стала миссия в Либерии в 1993 году. Региональные силы были направлены туда Экономическим сообществом западноафриканских государств (ЭКОВАС). В 1994 году операция ООН в Грузии начала сотрудничать с миротворческими силами Содружества Независимых Государств (СНГ). Во второй половине 90-х годов такие операции, как МООНБГ в Боснии и Герцеговине и МООНК в Косово, проводились в тандеме с НАТО, Европейским союзом и Организацией по безопасности и сотрудничеству в Европе (ОБСЕ). В Афганистане возглавляемые НАТО Международные силы содействия безопасности для Афганистана тесно взаимодействуют с миссией ООН по оказанию политической поддержки.

В последнее время другие партнеры по деятельности по поддержанию мира стали оказывать ООН содействие в критических ситуациях с целью заполнить пробелы, возникающие при развертывании, и восполнить нехватку личного состава и продолжить наращивание потенциала быстрого развертывания. В июле 2003 года развернутые в рамках Операции «Артемида» в Демократической Республике Конго под руководством Франции силы ЕС стабилизировали обстановку в Бунии, провинция Итури, где воюющие стороны терроризировали гражданское население. Эти силы, получившие от Совета Безопасности мандат на 90 дней, стабилизировали обстановку, разоружили вооруженные группы, спасли жизнь тысяч гражданских лиц и выиграли время, необходимое ООН для формирования расширенного контингента для развертывания в Бунии.

В октябре 2003 года в Либерии, а после этого в Кот-д'Ивуаре силы ЭКОВАС подготовили почву для развертывания войск ООН. По такой же схеме было организовано сотрудничество с миссией Африканского союза по поддержанию мира в Бурунди и с Многонациональными временными силами в Гаити. Кроме того, по инициативе Африканского союза в Африке были сформированы региональные бригады, вошедшие в состав Африканских резервных сил. В Дарфуре ООН и Миссия АС в Судане (МАСС) взаимодействуют в связи с развертыванием в Аддис-Абебе группы ООН по оказанию содействия; по линии своих соответствующих специальных представителей в Хартуме; и на месте — в самом Дарфуре.

ООН сотрудничает с АС и в других районах Африки: в контексте деятельности МООНРЗС в Западной Сахаре, ОНЮБ в Бурунди, МООНКИ в Кот-д'Ивуаре, МООНЭЭ в Эфиопии и Эритрее. Поддержка, оказываемая ООН миротворческим усилиям АС, приобрела еще большее значение после того, как участники Всемирного саммита одобрили десятилетнюю программу формирования миротворческого потенциала Африки.

Кроме того, Организация Объединенных Наций продолжает свое сотрудничество с ЕС, в том числе, в частности, в ДРК и Косово, и стремится к укреплению взаимодействия с другими региональными организациями и механизмами, включая НАТО, ОБСЕ, СНГ и Ассоциацию государств Юго-Восточной Азии (АСЕАН).