原子能机构核查活动和防扩散制度在整体上面临以下一些方面的挑战：国际恐怖主义势力的上升、秘密核计划的发现、隐蔽核供应网络的出现以及越来越多的国家获得敏感核技术和核能力。原子能机构已对这些挑战作出了响应，例如调查和分析了隐蔽核网络的核交易活动。总干事在2004年6月还指定了一个国际专家组，针对核燃料循环的前端和后端（浓缩、后处理以及乏燃料的贮存和最终处置）提出了可能的多边方案。
保障计划和标准的审查
2004年完成了2项审查，其一涉及保障执行的有效性，其二涉及保障标准。
由独立外部专家小组进行的第一项审查认为，特别是考虑到现有的资源限制，秘书处在实施保障加强措施方面已经做了很好的工作。该小组得出结论认为，在过去的5年中，原子能机构就不存在未申报的核材料提供可信保证以及就己申报的核材料未被转用提供持续保证的能力已经明显增强。
由原子能机构保障执行常设咨询组（保障咨询组）进行的第二项审查涉及原子能机构保障标准的作用、结构和内容。保障咨询组认为保障标准基本上是健全的，但也指出了有待改进的领域，并认识到原子能机构业己开始进行它所核可的一些修改。保障咨询组和外部小组均得出结论认为，更广泛地实施一体化保障并提高其有效性和效率仍然应当是一个计划优先事项。
超越国界的秘密核交易网
2004年期间披露了一个与伊朗未申报的核活动和利比亚秘密核武器计划有关的大范围敏感核技术秘密供应网。理事会要求原子能机构进一步评价由披露的这些问题所导致的活动，以改进对违反国际承诺的未申报核活动的探查。
作为响应，秘书处设立了一个以编制文件、调查和分析世界范围内核交易活动为重点的新单位。这些工作的总目标是揭露秘密核交易网，从而能够揭示未申报核材料和核活动的存在。
这些活动是对原子能机构有关保障的其他活动如分析公开来源资料等的补充。在成员国的支持下，例如通过提供有关拒绝出口和试图获取敏感核技术的相关资料，原子能机构的有效性和效率能够得到进一步加强。
| 
